部队实行的是党委领导下的双首长工作制，军政长官平级。区别是司令员主要负责军事业务，政委负责思政工作；军事上一般司令员说了算，其他组织、干部、人事等工作政委说了算；司令员是部队党委副书记，政委是党委书记，日常军事事务一般由司令员负责，但是碰到重要问题、重大事项，需提交党委会研究决定，政委作为党委书记有行使民主决策的权力，有时司令员也得尊重政委的意见。两个人不分大小，各负其责，互为牵制，形成了特有的领导体制。
部队司令员一般是师级以上的编制才有，像军区司令、集团军司令、空军司令、纵队司令和方面军司令以及警备区和军分区司令等。担任司令的军衔视所属部队的规模而有所不同，不过至少是上校以上。
一、战区司令员和政委
我国目前分五大战区，指的是东部战区、南部战区、西部战区、北部战区、中部战区，为正大军区级，司令员和政委一般都是上将级别。
二、军种司令员和政委
海军、空军、火箭军和战略支援部队四大军种都是正大军区级，司令员和政委衔授上将。其中海军司令员、空军司令员和火箭军司令员目前都是军委委员，享受副国级待遇。
联勤保障部队和武警部队为副大军区级，司令员和政委一般是中将，也有授上将的个案。
四、集团军司令员和政委
集团军一般为正军级建制，司令员和政委一般是少将，少数中将。
五、军区司令员和政委
各省市自治区军区和集团军一样，都是正军级建制，司令员和政委一般是少将。
六、军分区司令员和政委
军分区主要集中在地市，司令员和政委一般是正师大校军衔。