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近期，《Journal of Medical Virology》（JMV）刊登了一项重要研究，首次在南美洲的蝙蝠中发现了一种类似于中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）的新型冠状病毒。这一发现标志着冠状病毒的传播链条可能更加复杂，存在更高的物种传播风险。

巴西圣保罗州和塞阿拉州的研究人员与中国香港大学的同事合作，在蝙蝠中发现了一种新型的冠状病毒。研究人员在刺突蛋白的受体结合域（RBD）中发现了关键残基，表明这种病毒可能与MERS-CoV的受体DPP4相互作用。这些发现凸显了冠状病毒的广泛遗传多样性、新病毒谱系的存在以及在巴西传播的蝙蝠冠状病毒中发生的重组事件，并强调了持续监测与冠状病毒溢出事件相关的公共卫生风险的必要性。

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研究人员在2022年5月至2023年7月期间从巴西东北部塞阿拉州的不同地理来源采集了样本。这项研究旨在通过分子检测筛选来自16种不同蝙蝠物种的423个口腔和直肠拭子，然后进行深度RNA测序（RNA-Seq）和进化分析，以识别冠状病毒。

主要发现

1. 类似MERS的冠状病毒

研究人员在两种蝙蝠物种（Molossus molossus和Artibeus lituratus）中检测出了七种不同的冠状病毒（CoVs）。通过RNA-Seq获得病毒基因组信息，并利用MegaBLAST和BLASTn分析基因序列的同源性。为了填补基因组中的空白区域，研究团队设计了一套新的引物并通过Sanger测序完成了扩增。

其中一株病毒（BetaCoV UNIFESP mBSS）与中东呼吸综合征相关冠状病毒（MERSr-CoV）具有71.9%的核苷酸相似度，且覆盖了82.8%的病毒基因组。该病毒的发现引发了对该地区可能存在人畜共患传染病风险的关注。

2. 重组信号

研究人员利用多种算法（如RDP、GENECONV、MaxChi等）对病毒基因组进行了重组检测。结果显示，存在明显的重组信号，尤其在刺突蛋白编码基因区域（spike gene）。

此外，研究还发现了一种SARSr-CoV样病毒，其基因组覆盖率为30%，与SARSr-CoV具有65.1%的核苷酸相似性。研究团队还鉴定出了多种其他冠状病毒，包括：

与人类普通感冒相关的229E样蝙蝠冠状病毒

Tylonycteris bat CoV HKU4（与MERSr-CoV密切相关）

Pipistrellus bat CoV HKU5（与Vs-CoV-1类似）

Hedgehog-CoV-1（与刺猬冠状病毒和Betacoronavirus Erinaceus具有较高相似性）

通过最大似然（Maximum Likelihood）系统发育树分析，研究发现部分病毒可能属于未分类的冠状病毒。进一步的基因组比对显示，这些新发现的CoVs在RBD（受体结合域）上具有多种关键氨基酸残基（如P463、Y499、D510、D537、Y540、R542），这可能影响其与人类受体DPP4的结合能力。

为了弄清楚这些病毒是否能与人体细胞结合，必须在高生物安全性实验室进行实验。这些试验计划于2025年在香港大学进行。

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研究强调了南美洲蝙蝠体内存在丰富的冠状病毒多样性，其中一些病毒与MERSr-CoV等人畜共患病原体存在较高的相似性，提示这些病毒可能存在跨种传播和适应人类宿主的潜力。

综上所述，这项研究揭示了南美洲蝙蝠中存在一种类似于MERS-CoV的新型冠状病毒，进一步揭示了冠状病毒的复杂性和潜在的人畜共患风险。研究结果为全球公共卫生安全提供了重要的科学依据，并呼吁加强跨物种传播的监测和防控措施。

参考

Silvério, Bruna Stefanie, et al. "Coronavirus Cryptic Landscape and Draft Genome of a Novel CoV Clade Related to MERS From Bats Circulating in Northeastern Brazil." Journal of Medical Virology 97.1 (2025): e70173.